Genetiske analyser - hva betyr begrepene?
Sekvensering
Bestemmelse av rekkefølgen av basene i DNA: adenin (A), cytosin (C), guanin (G), thymin (T)
DNA
Molekyl som danner arvestoffet i alle celler. Forkortelse for desoxyribonukleinsyre på engelsk (deoxyribonucleic acid).
Fylogenetisk tre
Måte å illustrere slektskap mellom ulike arter. Den vanligste måten å konstruere slektskap på er å sammenlikne arters DNA. Arter med få forskjeller mellom basene i DNAet er nærmere beslektet med hverandre enn arter med flere forskjeller i DNAet.
Antimikrobielle resistens
Mikroorganismens evne til å motstå effekten av antimikrobielle midler, altså midler som skal drepe eller hemme veksten av bakterier, sopp eller virus (feks.ulike desinfeksjonsmiddel eller antibiotika).
Virulensfaktorer
Virulens er en mikroorganismes evne til å fremkalle sykdom. Virulensfaktorer avgjør hvor sykdomsfremkallende mikroorganismen er. Eksempler på virulensfaktorer er evne til å feste seg på og invadere vev, spredningsevne, toksinproduksjon og interaksjon med og eventuell ødeleggelse av vertscellen og vertens immunforsvar. (Fra store medisinske leksikon)
Genom
Komplett arvematerial til en organisme
Klassisk DNA-typing (f.eks. MLVA) |
Helgenomsekvensering |
|
Mikrorganisme |
Listeria monocytogenes | Hele genomet |
Oppløsningsevne |
MLVA har bedre oppløsning enn serotyping | Oppløsning ned mot enkeltmutasjoner |
Bruksområde |
Overvåking av patogenkontaminering Utbruddoppklaring |
Overvåking av patogenkontaminering Utbruddoppklaring Metagenom analyse Microbiota screening Autentisitetskontroll |